如果社保系统未留存照片，可以采取以下措施进行处理。

首先，可以要求参保人提供一张近期的照片，以确保系统中有准确的身份信息。

其次，可以要求参保人提供其他身份证明文件，如身份证、护照等，以补充系统中的信息。

另外，可以与参保人联系，要求其前往社保机构进行面谈，以确认其身份并采集照片。

最后，社保机构可以加强信息管理和采集流程，确保将参保人的照片及时录入系统，以提高数据的准确性和完整性。